タンパク質言語モデル（pLM）は、機能、構造、進化に関する情報をエンコードするタンパク質ごとの埋め込みを生成するが、これらの表現で捉えられた関係を体系的に探索することは依然として困難である。ProtSpace（https://protspace.app）は、pLM埋め込み空…

2024/02/07 タイトル変更 人工知能はタンパク質構造予測の分野に革命をもたらした。しかし、より強力で複雑なソフトウェアが開発されるにつれ、エンドユーザーにとって制限要因になりつつあるのは、能力よりもむしろアクセシビリティと使いやすさである。こ…

2021 7/2, 7/5, 7/6 追記 2021 10/7 論文引用 2021 10/15 ツイート追記 複雑な微生物群集のメタゲノムアセンブルゲノム（MAG）の再構築により、種間・種内の遺伝的多様性が明らかになってきた。しかし、代謝モデリングの取り組みは、ゲノムスケールの代謝モ…