macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

Bioinformatics Advances

ゲノムワイドなSNPデータとメタデータを同時に調べるためのウェブアプリケーション Evidente

病原体やその系統の解析では、一塩基多型(SNP)を用いてその進化史を再構築することが一般的である。しかし、ゲノムワイドなSNPベースの系統樹がさらなる情報なしに解析されることはほとんどない。SNPのデータだけでなく、サンプルのメタデータも含めて解析…

ネットワークベースのパスウェイアノテーションのためのウェブサーバー PathBIX

パスウェイアノテーションは、生命科学における実験データを解釈し、意味を与えるための重要なツールである。このタスクのために数多くのツールが存在するが、最新世代のパスウェイエンリッチメント解析ツールであるネットワークベース法は、単に遺伝子の内…