2023/02/24 誤字修正 2023/09/06 追記 nf-core/rnaseqはnextflow DSL2を使って構築されているRNAシーケンスデータを解析するためのパイプライン。2023年2月現在、nf-coreのベストプラクティスに従ったパイプラインは76個公開されている。このnf-coreの中で最…

fgbioはディープシーケンシングデータを扱うためのコマンドラインツールキット。リードレベルのデータ（FASTQ、SAM、BAMなど）やバリアントレベルのデータ（VCF、BCFなど）を操作する。特に次のようなものを提供することに重点を置いている（Githubより）。 …