macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2006

プライマーがどれだけユニークか調べるwebツール GenomeTester 1.3

GenomeTester 1.3はプライマーペアの結合サイトをゲノム全体から調べて、どれだけの断片が増幅されるのか予測するツール。データベース化されたヒトゲノムといくつかのモデル真核生物ゲノムで使用できる。 webサーバー http://bioinfo.ebc.ee/genometester/ …

配列をクラスタリングする CD-HIT

2018 12/12 追記、6/18 インストール追記、7/24 help追加、9/25 タイトル修正、11/28 ユーザーズガイドリンク追記 2024/01/31 追記 似た塩基配列やアミノ酸配列をクラスタリングできるツール。例えば、de novo transcriptome解析でアセンブルを行った後、95%…