Githubより シーケンサー技術の向上に伴い、クロマチン免疫沈降法とハイスループットシーケンス（ChIP-Seq）によるゲノム規模のタンパク質-DNA相互作用の研究が盛んになってきている。このようなChIP-Seqの強力な解析手法の欠如に対処するため、本著者らは転…

2019 5/8 インストール追記, 11/29 インストール追記 2020 7/12 仮想環境を作ってインストールするように変更, help追記（コメントいただいたstepも修正しました。）。8/11 リンク追加、誤字修正 2023/01/01 追記、diamond 追記 2023/04/15 step2のコマンド…

2012年にnatureでtophatとcufflinksを使ったRNA-seq解析の手法が発表されている。 http://www.nature.com/nprot/journal/v7/n3/full/nprot.2012.016.html tophat、bowtie、cufflinksなどを使ったいわゆるタキシードプロトコルはRNA seqの１つのワークフロー…