macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2024-05-23から1日間の記事一覧

大規模なデータセットにもスケールする多目的k-merカウンターおよび多様性推定器 MerCat2

MerCat2("Mer-Catenate2")は、オミックスデータ中のフィーチャーをロバストに解析するための、汎用性、並列性、拡張性、モジュール性を備えたソフトウェアパッケージである。MerCat2は、あらゆるプラットフォームからのHTSシークエンシングの生リード、ア…

T2Tアセンブリのテロメア配列を同定する T2T_chromosomes.shスクリプト

本スクリプト T2T_chromosomes.shは、テロメア-2-テロメアのアセンブリ配列末端のテロメアリピートを同定する。定義として、リファレンスの染色体を指定し、それの全長をカバーしているアセンブリ配列であることと、そのようなアセンブリ配列の両端にユーザ…