macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2025-10-14から1日間の記事一覧

ゲノム間のアラインメントを高速に行う FastGA

FastGAは、同等の感度を持つ従来手法と比較して1桁以上高速に2つのゲノム配列間のアラインメントを発見する。その高速性は以下の要因による:(a) MSD基数ソートとマージのみを伴う完全キャッシュローカルアーキテクチャ、(b) ソート済みk-merテーブルの線形…