macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2025-09-30から1日間の記事一覧

ロングリードベースの真核生物アセンブリを7つの指標で評価する PAQman

ロングリードシーケンシングとアセンブリアルゴリズムの進歩により、高品質なゲノムアセンブリの生成はより容易かつ費用対効果の高いものとなった。しかし、既存ツールはしばしば限られた指標に依存し、あるいは比較用のリファレンスアセンブリを必要とする…

表現型マルチオミクスデータと微生物パンゲノムの迅速な関連付けを行う Scoary2

細菌の遺伝子機能解明は、食品生産、薬理学、生態学など様々な分野の進展を牽引している。オミクス技術が高次元の表現型データを捕捉する一方で、それらをゲノムデータと関連付けることは困難であり、細菌遺伝子の40~60%が未解明のままである。このボトル…