微生物群集の全ゲノム配列を決定するメタゲノミクスは、複雑な生態系に対する洞察を提供してきた。新規微生物の発見を容易にし、群集の相互作用を説明し、様々な分野で応用されている。ハイスループットと第3世代シーケンシング技術の進歩は、その普及にさら…

tmhmm.pyはPython 3.5+で実装された transmembrane helix hidden Markov model (TMHMM) 。以下の理由で公開されている。 公開されているのはいくつかの理由がある： ソースコードが出版物の一部として入手できない、 ダウンロード可能なバイナリはLinux専用…

原核生物の転写因子はリガンドによって遺伝子発現を制御するバイオセンサーとして利用可能であるが、現在はバイオセンサーが存在する化学リガンドのランドスケープは極めて限られている。この状況を拡大するために、本著者らは、enzyme reaction databasesの…