macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2024-04-06から1日間の記事一覧

ギャップフリーゲノムアセンブリとセントロメリックリピート同定のためのT2Tツールキット quarTeT

2024/04/08 CLI追記 高品質なゲノムは、機能的、進化的、比較ゲノム研究の基礎である。telomere-to-telomere (T2T)アセンブリという新しい時代の到来とともに、複雑な染色体構造や高度な反復配列の解明に注目が集まっている。しかし、T2Tゲノムの自動構築や…

BinDash 2.0

公開データベースに寄託される微生物ゲノムの数が増加しているため、多数のゲノムをゲノム距離という観点から比較することは、ますます困難になってきている。現在では、数百万から数十億のゲノム間のペアワイズ距離を推定する必要がある。このような比較を…