macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2023-05-02から1日間の記事一覧

配列ファイルを堅牢かつ再現性よく操作するためのユーティリティ群 SeqFu

配列ファイル形式(FASTAおよびFASTQ)は、バイオインフォマティクス、分子生物学、生化学の分野でよく使用されている。次世代シーケンサー(NGS)の登場により、FASTQデータセットの作成・解析数は飛躍的に増加しており、これらのファイルを効率的に取り扱…

出版品質のプラスミドマップを生成、編集、注釈、視覚化するためのウェブサーバー PlasMapper 3.0

PlasMapper 3.0は、出版品質のプラスミドマップを生成、編集、注釈、対話的に可視化できるウェブサーバーである。プラスミドマップは、遺伝子クローニング実験に関する重要な情報を計画、設計、共有、公開するために使用される。PlasMapper 3.0は、PlasMappe…

メモリ使用量を計測する memusg

memusgはプロセスのメモリ使用量をlinuxのタイムコマンドのように計測するツール。 timeと同様にプログラムの前に付けて使用する。 インストール Gihtub git clone https://github.com/jhclark/memusg.gitexport PATH=<path>/<to>/memusg:$PATH 実行方法 memusg sleep </to></path>…