macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2023-03-12から1日間の記事一覧

シークエンシングデータのクオリティコントロールを行う seqqc

レポジトリより Arcadia-Science/seqqcは、シーケンシングデータの品質管理のための解析パイプラインである。このパイプラインは、ショートリードまたはロングリードのシーケンスデータ(FASTQフォーマット)に使用でき、アダプターの存在、高いシーケンス重…

ファージゲノムのアノテーションと解析のためのウェブサーバー PhaGAA

ファージゲノムアノテーションは、ファージ治療の設計に重要な役割を果たす。これまで、ファージのゲノムアノテーションツールは様々なものがあったが、その多くは単機能のアノテーションに特化したもので、操作プロセスも複雑だった。そのため、ファージゲ…