profileHMMsFromFASTA.pyは、RefSeqのような大規模な（ウイルスの）タンパク質セットからカスタマイズされたプロファイルHMMを構築するスクリプト。 スクリプトの<DESCRIPTION>より（一部改変） このスクリプトは、タンパク質配列を含むFASTAファイルを入力とし、最終的に</description>…

メタゲノムアセンブリゲノム（MAG）は、微生物の機能についての理解を大幅に広げている。しかし、系統解析や環境調査でよく用いられる16S rRNA遺伝子は、MAGから欠落していることが多い。そこで、ペアエンドシーケンスリードを用いて、16S rRNA遺伝子とMAGを…