macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-11-27から1日間の記事一覧

グラフ構造に基づいてキメラコンティグを識別する、ショートリードのde novo transcriptomeアセンブラCStone

RNA-Seq実験で得られたコンティグを含め、過去10年間に蓄積された配列情報は飛躍的に増加しており、リードデータをアセンブルする際にはキメラ配列の定量が必須となっている。トランスクリプトームでは、de novoでアセンブリされたキメラは、基本的な転写産…