macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-08-15から1日間の記事一覧

MethylDackel

MethylDackel(以前の名前はPileOMethで、これはMETHylationメトリクスを抽出するためにPILEupを使用していたための仮の名前だった)は、何らかの形でBS-seqのアラインメントを含む、座標順にソートされ、インデックスが付けられたBAMまたはCRAMファイルを処…

トランスポゾン挿入部位を正確に同定する ITIS

転移因子は、ゲノムの重要な部分を構成し、適応メカニズムに不可欠である。表現型の変化に関連するトランスポジション現象は、自然に発生するか、挿入型の突然変異体集団で誘発される。トランスポゾンを用いた変異誘発では、複数のランダムな挿入が起こり、…