macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-08-11から1日間の記事一覧

ウィルスゲノムの株を識別したde novoアセンブリを行う Haploflow

ウィルス感染症では、共同感染や宿主内での進化により、複数の関連するウィルス株が存在することが多い。HaploflowはdeBruijnグラフをベースにしたアセンブラで、新しいフローアルゴリズムを用いて混合されたシークエンシングサンプルからウイルスの株レベル…