macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-07-22から1日間の記事一覧

Bandageのreduceコマンドを使ってアセンブリグラフから特定のノードを取り出す

Bandageのreduceコマンドを使うと、アセンブリググラフの中のターゲット配列を、隣接するノードと一緒に取り出すことができます。また、特定のカバレッジ範囲内にあるアセンブリグラフだけ取り出したりもできるため、メタゲノムアセンブリから一定の存在量の…