macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2018-05-01から1日間の記事一覧

ロングリードのシミュレーター SiLiCO

2019 7/28コマンド追記 広範に使用されているPacBioプラットフォームおよびOxford Nanoporeプラットフォームを含む長いリード配列決定プラットフォームは、15〜20キロベースを超える配列断片を生成することを目的としており、構造変異の同定およびゲノムアセ…

K-mer分析ツール KAT

2019 5/15 リンク、condaインストール追加 2019 5/16 タイトル修正 2020 9/27 help更新 ハイスループットの全ゲノムショットガン(WGS)データセットの迅速な解析は、大きなサイズが生み出す複雑さのためにチャレンジングである(Schatz et al、2012)。 WGS…