2018-04-28から1日間の記事一覧
k-mer
polyploid
assembly
evaluation tool
repetitive sequences
fasta/fastqの操作
duplication
結果の視覚化 (visualization)
ゲノム比較 (comparative genomics)
docker
2019 3/5 インストール追記、コマンドのわかりにくい部分を修正 2019 5/14 リンク追加 2019 5/27 docker追加、オプションヘルプ追加 2019 8/27 twitter追記 ハイスループットシーケンシングにより、新規ゲノムのシーケンシングが日常的に可能になっている。…
VCF
bam/sam
structural variations (SV)
結果の視覚化 (visualization)
repetitive sequences
evaluation tool
2020
Preprint
2021
Genome Biology
2020 9/26 Preprint引用、condaによるインストールコマンド、help追記 2021 5/27 論文追記 構造変異(SV)検出において、視覚的な検証は偽陽性を排除するために不可欠なステップである。著者らは、ショートリード、ロングリード、フェーズドリードを含む、複…
SVGen Documentより 構造変異(SV)用の既存のシミュレーションツールは、一部はSNV(single-nucleotide variants)をシミュレートせず、またシミュレートされたシーケンスリードを生成してSVコーラーソフトウェアをベンチマークする外部プログラムが必要と…