macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2025-05-31から1日間の記事一覧

細菌ゲノムのロングリードコンセンサスアセンブリを行う Autocycler

2025/09/03論文追記 ロングリードシーケンスにより完全な細菌ゲノムアセンブリが可能になるが、個々のアセンブラは不完全であり、しばしば配列レベルや構造エラーが生じる。Trycyclerを用いたコンセンサスアセンブリは精度を向上させることができるが、自動…

ロングリードのメタゲノムアセンブラ myloasm

2025/09/09 プレプリント引用 ロングリードメタゲノムアセンブリは、マイクロバイオームからの完全なゲノム復元を約束する。しかし、メタゲノムの複雑性は課題をもたらす。本著者らは、PacBio HiFiおよびOxford Nanopore Technologies (ONT) R10.4ロングリー…