macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2023-05-05から1日間の記事一覧

対比学習による酵素機能の予測ツール CLEAN

酵素の機能アノテーションは基本的な課題であり、数多くの計算機ツールが開発されている。しかし、これらのツールの多くは、研究が進んでいないタンパク質や、これまで解明されていない機能や複数の活性を持つタンパク質について、enzyme commission(EC)番…

HiFiロングリードアセンブリのためのリピートを認識したポリッシングツール NextPolish2

PacBio社が開発した高忠実度(HiFi)ロングリードシーケンス技術により、ゲノムアセンブリの塩基レベルの精度は大幅に向上したが、これらのアセンブリには、特にHiFiロングリードのエラーが発生しやすい領域内に、塩基レベルのエラーが残っている。しかし、…