macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2025-09-11から1日間の記事一覧

fastpのバッチ処理スクリプトを使う

fastpのversion 1.0がリリースされ、フォルダ内のfastqをバッチ処理する便利なスクリプトも提供されました。このスクリプトの使い方を確認しておきます。 インストール Github #bioconda (link) v.1系指定、最新バージョンはリンク先確認mamba install -c bi…

ピークコール結果から遺伝子へのマッピングを行う peakScout

peakScoutは、ゲノムピークデータと遺伝子アノテーションの間のギャップを迅速かつ容易に埋めるために設計されたコマンドラインおよびウェブベースのバイオインフォマティクスツールであり、研究者が調節エレメントの測定値とその標的遺伝子との関係を理解す…