macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2025-02-24から1日間の記事一覧

原核生物アセンブリのための包括的でスケーラブルなNextflowアノテーションパイプライン mettannotator

近年、原核生物のゲノムアセンブリが急増しており、単離された生物や環境サンプルの両方から得られている。これらのアセンブリには、リファレンスデータベースでは十分に表現されていない新規の生物種が含まれることが多く、よく記述されている分類群と新規…

セントロメアのde novoアノテーションを行う centroAnno

2025/02/27 追記 正確なセントロメアのアノテーションは、染色体の安定性、遺伝子制御、複雑なゲノム構造を解明するために不可欠である。しかし、既存のアノテーション手法は、予備知識に依存することが多く、多様なゲノム状況への適用には限界がある。本研…