macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2025-01-14から1日間の記事一覧

Hi-CデータとロングリードDe Bruijnグラフの統合による効率的なテロメア間ゲノムアセンブリを行う Verkko2

2025/06/06 論文引用 テロメア・ツー・テロメア・コンソーシアムは最近、ヒトゲノムの初の完全な配列を完成させた。最も複雑な繰り返しを解決するために、このプロジェクトは、長くて正確なPacBio HiFiとウルトラロングOxford Nanoporeシーケンスリードの半…

FASTQ headersのバーコード情報によってdemultiplexingする fastq_demux

fastq_demuxはFASTQヘッダーのバーコードに基づいてillumina fastqをデマルチプレックスするシンプルなプログラム。 インストール condaで環境を作って導入した。 Github mamba create -n fastq_demux python=3 -yconda activate fastq_demux#本体git clone …