macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2024-08-24から1日間の記事一覧

特定の分類群に特化したDBを使うことでkrakenのリソース使用量を減らす

2024/08/26 誤字修正 Kraken2はシークエンシングリードから菌叢解析を行うプログラムです。事前に作成されたRefSeq完全長ゲノムのDBなどを使って、シークエンシングリードの超高速な分類学的分類を実行できます。 kraken2はkraken1と比べてメモリ使用率が大…