macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2024-05-04から1日間の記事一覧

膣内細菌叢の16S rRNA遺伝子の分類学的分類を配列ごとに迅速かつ正確に行う SpeciateIT

大量の16S rRNA遺伝子配列を分類学的に分類するには、OTUへのクラスタリングやノイズ除去法が主流である。本著者らは、個々のアンプリコン配列を迅速かつ正確に分類する新しい分類学的分類ツールspeciateITを開発した(https://github.com/Ravel-Laboratory/…