macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2023-12-22から1日間の記事一覧

ヒトとマウスの転写因子結合部位予測ウェブツール TFBSPred

転写因子(TF)は遺伝子の発現調節に大きな役割を果たしている。各遺伝子の制御領域に結合するTFを発見することは、長年の研究の焦点であった。TF結合部位(TFBS)の実験的検証は複雑なプロセスであるため、予測を行うウェブツールが開発されてきた。しかし、…

メタゲノムロングリードの分類学的分類と定量を行う Melon

ロングリードシーケンスは、複雑な微生物群集の特徴を明らかにする上で大きな可能性を秘めているが、ロングリード専用に設計された分類学的プロファイリングツールはまだ不足している。ここでは、ロングリードのユニークな特性を生かしたマーカーベースの分…