macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2023-02-22から1日間の記事一覧

細菌の分類学的に制限された遺伝子を探索するためのリソース TRGdb

TRGdbデータベースは、バクテリアの分類学的制限遺伝子(TRG)に特化したリソースである。最新の細菌分類学に基づき、異なる属や種に特異的な遺伝子を包括的に収集している。ユーザーインターフェースは、ブラウズや検索、配列の類似性探索を容易にする。また…

保存されているタンパク質ドメインを検索するNCBIの CD-Search

2023/02/22 タイトル修正 2004年に最初の論文(ref.1)が出たNCBIのCD-Searchサービスは、RPS-BLASTを用いてクエリタンパク質配列を多くのソースデータベースから収集された保存ドメインモデルと比較し、保存されているタンパク質ドメインヒットを提示する。…