macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2022-12-30から1日間の記事一覧

AUGUSTUSの訓練と遺伝子予測のためのウェブサービス WebAUGUSTUS

2023/01/01 誤字修正 タンパク質をコードする遺伝子の予測は、新たにシークエンシングされアセンブルされたゲノムのアノテーションにおいて重要なステップである。AUGUSTUSは真核生物の遺伝子予測のための最も正確なツールの一つである。ここでは、AUGUSTUS…

シークエンシングリードからk-merカウントを使用してテロメアリピートを予測する telomere-kmer-search

レポジトリより telomere-kmer-searchは、テロメアが与えられたゲノムライブラリの中で最も豊富なダイレクトタンデムリピート配列であると仮定してテロメアリピートを予測する。出力は、頻度順に並べたダイレクトタンデムリピートユニット配列のリストである…