マニュアルより gtdbtkのde novo ワークフローは、ユーザー提供のゲノムと GTDB-Tk リファレンスゲノムを含むバクテリアと古細菌のツリーを推論する。分類学的な分類を得るにはclassify_wfワークフローを推奨し、de novoでdomain固有のツリーが必要な場合の…

8/8 誤字修正 QIIME1のfilter_tree.pyスクリプト（QIIME2ではqiime phylogeny filter-tree）は、系統樹ファイルから入力されたリスト（OTU名、ゲノム名など）で見つかったツリーのチップだけを保持するサブツリーを出力する。-negateオプションのTRUEフラグ…