macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2022-08-01から1日間の記事一覧

Sourmashのgatherコマンド

Sourmash helpより Sourmashのサブコマンド `gather` は、メタゲノム解析で最適なリファレンスゲノム(のシグネチャファイル)をリファレンスゲノムデータベースから選択する。 k-merは非常に特異的なので、Sourmash gather は、過去にシークエンシングされ…