macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-08-06から1日間の記事一覧

コピーナンバーバリアント(CNV)のシミュレータ SECNVs

コピーナンバーバリアントは、表現型の変化やヒトの病気に重要な役割を果たすゲノムの複製や欠失である。全ゲノム配列や全エクソーム配列のデータを用いて、コピー数の変異を検出するソフトウェアが数多く開発されている。しかし、これらのアプリケーション…

MSIsensor

マイクロサテライト不安定性(MSI)は、より大きなゲノム不安定性の重要な指標であり、リンチ症候群をはじめとする多くの遺伝病と関連している。また、MSIの状態は、大腸がんや子宮内膜がんなどの複数のがん種において、良好な生存率を示す独立した予後因子…