macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-04-01から1日間の記事一覧

アセンブリのinterrupted ORFsを評価する ideel

ideelはバクテリア/微生物ゲノムアセンブリの中断されたORFの評価を行うツール。 インストール Github git clone https://github.com/mw55309/ideel.gitcd ideel/ Snakefileを開いてuniprot tremblなどのdiamond databaseのパスを修正する。 実行方法 クロー…