macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-08-08から1日間の記事一覧

fastq / fastaの操作ツール seqkit

2019 4/15 Githubリンク追加 2019 6/21 seqmit sample コマンド追記 2019 8/7 help追加 2019 8/8 stats追記 2020 3/18 help更新 2021 ツイート追加(対応するバージョンを使っている人は注意) 2016年に発表されたfastqの操作ツール。競合ツールより多機能と…

クレード特異的マーカー遺伝子を使いメタゲノム配列のtaxnomy assigmentを行う MetaPhlAn2、クラスタリングするHclust2、系統樹を作成するGraPhlAn

2019 5/17 condaインストール追記、イントロ文章修正、 2019 7/2タイトル修正 2019 7/4 インストール追記 2019 7/6 インストール追記タイトル修正、誤解を招く文章を削除 2019 10/8 インストール追記 2020 8/24 condaインストール追記 2021 7/16 mambaに変更…