macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-06-10から1日間の記事一覧

CGView Comparison Toolによるバクテリアのゲノム比較 インストール編

2020 6/18 インストール追記 CGView Comparison ToolはStothardの研究グループが公開しているバクテリアやプラスミドのゲノム比較ツール(以下CCT)である。複数ゲノムを比較して描画する機能を持つ。以下のような美しい図が簡単なコマンド指定だけで描ける…

GTFとGFFフォーマット

2019 10/15追記 2020 10/13 リンク削除 GTF(General Transfer Format))はgeneのアノテーション専用のフォーマットと定義されている。それに対してGFF(General Feature Format)はtranscriptなどにも使えるよりジェネラルなフォーマットとなっている。この…