macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2024-03-07から1日間の記事一覧

ブルームフィルタを用いて低メモリ使用量且つ高速にsamの重複マークを行う streammd

重複テンプレートの同定は、バルクシークエンシング解析における一般的な前処理ステップである。streammdは、Picard MarkDuplicatesの出力を忠実に再現しながら、大幅に高速化し、SAMBLASTERよりはるかに少ないメモリで動作する。streammdは、GitHub https:/…