macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-09-15から1日間の記事一覧

MMseqs2 コマンド其の3 既存のデータベースをダウンロードするmmseqs databasesコマンド

MMseqs2には非常に多くの機能があります。今回はmmseqs databasesコマンドを試します。mmseqs databasesを使うと、UniProtやGTDB、NCBI nr/ntなどからMMseqs2のデータベースとしてビルド済みのデータベースをダウンロードして、MMseqs2によるホモロジーサー…