macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2025-04-09から1日間の記事一覧

パンゲノム用の全ゲノムアライナー wfmash

レポジトリより wfmashはパンゲノム用のアライナーで、効率的な相同性マッピングと塩基レベルのアライメントを組み合わせている。MashMap 3.5を使用して配列間の近似マッピングを求め、WFA (Wave Front Alignment)を適用して塩基レベルのアラインメントを得…