macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2023-08-12から1日間の記事一覧

完全な環状ゲノムの開始位置(+1)を素早く変更する Dnaapler

レポジトリより(一部改変) Dnaaplerはシンプルなpythonプログラムで、一塩基の入力配列(FASTA形式)を受け取り、アミノ酸配列データベースに対してblastxを用いて目的の開始遺伝子を見つけ、この遺伝子の開始コドンが見つかったかどうかをチェックし、見…