macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2023-05-27から1日間の記事一覧

アノテーションパイプライン BRAKER3

2023/05/28, 5/30 誤字修正 2023/06/13 プレプリント引用 2024/02/19 ツイート追記 タンパク質配列やRNA-Seqライブラリの形で大量の外部エビデンスを提供するデータベースの利用可能性が高まっており、タンパク質コード遺伝子の遺伝子構造予測手法を改善する…

ウイルスコンセンサスゲノム配列をコールする高速でメモリ効率の良い実装 ViralConsensus

ウイルス分子疫学において、配列データからコンセンサスゲノムを再構成することは、懸念される変異やバリアントを追跡するために重要である。しかし、配列決定されるサンプル数が急増するにつれ、コンセンサスゲノムの再構築に必要な計算リソースは法外に大…