2024-04-17から1日間の記事一覧
WGSやRNA-seqやTarget-captureなどのさまざまなショートリードデータからユーザーが指定した数百〜数千の遺伝子座の同祖配列を抽出し、系統解析に使用可能なMSAを出力する CAPTUS
Preprint
Chloroplast DNA (plastome)
phylogenetic marker genes
phylogenetic tree Inference
mitochondria
automated pipeline
multiple sequence alignment (MSA)
系統解析
分子系統樹
2023
ターゲットキャプチャー、RNA-Seq、ゲノムスキミング、深く読んだ全ゲノムシーケンスなど、多様なハイスループットシーケンスデータは系統ゲノム解析に利用されているが、このようなミックスされたデータを単一の系統ゲノムデータセットに統合するには、多く…