macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2023-05-11から1日間の記事一覧

TSV形式のバリアントコールファイル(バリアントテーブル)をVCF形式に変換する tsv-vcf-converter

レポジトリより このツールは、tsvリソースのリフトオーバーを容易にするために作成された。特殊文字はほとんど扱えず、あらゆるTSVファイルやVCFファイルを変換するのには適していないが、一般的なTSV形式のバリアントコール結果(indel、SVには対応しない…

相同な遺伝子クラスターを迅速に検索・可視化する webサーバー CAGECAT

特殊な機能をコードする遺伝子の共局在は、微生物ゲノムに共通し、より大きな真核生物のゲノムにも存在する。重要な例として、薬用、農業用、工業用として価値のある特殊な代謝物(例:antimicrobials)を生産する生合成遺伝子クラスター(BGC)がある。BGC…