macでインフォマティクス

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HTS (NGS) 関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2021-10-04から1日間の記事一覧

生物の生存に不可欠な遺伝子のデータベース DEG(バージョン15アップデート)

必須遺伝子とは、生物が特定の条件下で生存するために必要な遺伝子のことである。バクテリアの最小遺伝子セットの研究では、生命を維持するための基本的な細胞プロセスが解明されている。この5年間、CRISPR/Cas9をさまざまな種類のヒト細胞に適用することに…

RNA-Seqデータ解析のためのスタンドアローンおよびクラウドベースのシステム RNAdetector

2022 1/18追記 RNA-Seqはトランスクリプトームプロファイリングに広く用いられている技術であり、コーディングおよびノンコーディングRNA分子の解析が可能である。しかし、この技術は、Real-Time PCRやマイクロアレイなどの他の伝統的な技術に比べて、解析に…

リファレンスゲノム情報を半教師あり深層学習で取り込むことで、より優れたビニングを実現する SemiBin

2022/02/09 ツイート追記 2022/02/27 追記 2022/03/01 help更新 メタゲノムビニングとは、メタゲノムアセンブルゲノム(MAG)を構築する際に、同一ゲノムに由来すると予測される配列を自動的にグループ化するステップである。最も広く利用されているビニング…