（ヒト）遺伝子発現解析のためデータ可視化とパスウェイエンリッチメント解析を統合したウェブツール STAGEs

　遺伝子発現プロファイリングは、生物学的プロセスや疾患の理解に多大な貢献をしてきた。しかし、データ可視化ツールやパスウェイ解析ツールの多くは、膨大なデータフォーマットを必要とするため、特にバイオインフォマティシャンでない人にとっては、処理されたデータを解釈して生物学的メカニズムを理解することは依然として困難である。このような課題を回避するために、著者らはオミックス解析の出力をインタラクティブに可視化するSTAGEs（Static and Temporal Analysis of Gene Expression studies）を開発した。ユーザーは、Excel スプレッドシートから作成したデータを直接アップロードし、STAGEsを使用して、ボルケーノプロット、差次発現遺伝子積み上げ棒グラフ、EnrichrおよびGene Set Enrichment Analysis（GSEA）によるパスウェイエンリッチメント解析、確立したパスウェイデータベースまたはカスタマイズした遺伝子セット、クラスターグラムおよび相関マトリックスを表示することができる。さらに、STAGEsはExcelの遺伝子と日付の誤変換を処理し、すべての遺伝子がパスウェイ解析に考慮されることを保証する。出力データの表やグラフはエクスポートでき、スライダー、ドロップダウンメニュー、テキストボックス、ラジオボタンなどのウィジェットを使用して、個々のグラフを簡単にカスタマイズできる。STAGEsは、データ解析、データ可視化、パスウェイ解析のための統合プラットフォームであり、https://kuanrongchan-stages-stages-vpgh46.streamlitapp.com/ で自由に利用できる。また、開発者は、https://github.com/kuanrongchan/STAGES で公開されている既存のコードに基づいて、ウェブツールをローカルにカスタマイズまたは変更できる。