2021-09-05から1日間の記事一覧
nextflow
metagenome
automated pipeline
hybrid assembly
Binning (metagenomics)
evaluation tool
nf-core
NAR Genomics and Bioinformatics
2022
2023/03/02 論文引用 ショットガンメタゲノムデータを解析することで、微生物群集に関する貴重な知見が得られると同時に、個々のゲノムレベルでの解決が可能となる。しかし、完全なリファレンスゲノムが存在しない場合、シークエンスリードからメタゲノムア…
CMSeqは、SegataLabで公開されている、リファレンスのカバレッジ、polymorphic サイト率、BAMからのコンセンサス配列計算のための.bamファイルへのインターフェースを提供するコマンド群。 インストール 依存 Requires: samtools (> 1.x) numpy pysam pandas…