macでインフォマティクス

macでインフォマティクス

NGS関連のインフォマティクス情報についてまとめています。

2017-06-20から1日間の記事一覧

Oxford Nanoporeリードのアセンブリ smartdenovo

SMARTdenovoは、PacBioおよびOxford Nanopore(ONT)データ用の新しいアセンブラ。 エラー訂正なしでリードをアライメントしてアセンブリを生成する。 SMARTdenovoはいくつかの独立したコマンドラインツールで構成されている:rawリードのall vs allのアライ…

ナノポアのアダプタートリミングツール Porechop

PorechopはOXford Nanoporeのリードのアダプタートリミングツール。データベースを保持しており、自動でアダプター配列を認識し除去してくれる。マルチプレックスのidnex配列を除く機能も持つ。 ダウンロードリンク GitHub - rrwick/Porechop: Adapter trimm…