PhotoModPlus - macでインフォマティクス

　Genome neighborhood networks（GNN）とGenome neighborhood （GN）ベースの機械学習を用いて光合成タンパク質を予測するためのプラットフォームとして、PhotoModPlusと呼ばれる新しいウェブサーバを紹介する。GNNは、複数の光合成原核生物ゲノムから得られた保存されたGN遺伝子の概要を可視化することを可能にし、クエリ入力に対する機能的なガイダンスを提供する。また、このプラットフォームでは、原核生物の光合成関連の24のGO termに基づいて光合成特異的な機能を予測するための、GN特徴を活用した新しい機械学習モデル、すなわちPhotoModGOを発表する。この新しいモデルは，入れ子になった5回のクロスバリデーションに基づくF1指標が0.872となり，配列に基づくアプローチよりも優れた性能を示した．最後に，このウェブサーバと新しいモデルを，新規の光合成タンパク質の同定に応用してた。このサーバーは使いやすく、すべてのデバイスに対応しており、bicep.kmutt.ac.th/photomodで利用できる。