そのままのツールです。ツイッターで教えてもらいました。
インストール
mac os 10.13のpython3.4でテストした（pyton2環境でも多分動きます）。
依存
- pyemojify
- BioPython
- NumPy
pipで必要なライブラリを入れておく。
pip install pyemojify numpy Biopython
本体 Github
ラン
実行するにはfastqファイルを引数で指定する（iIllumina 1.8+/Sanger format）。
python input.fq
InSilicoSeq（リンク）を使い発生させたリードを分析してみる。
#ランダムにバクテリアゲノムを1つダウンロードしてリードを発生
iss generate --ncbi bacteria -u 1 --model NovaSeq --output ncbi_reads -p 8
分析実行
python fastqe.py ncbi_reads_R1.fastq
python fastqe.py ncbi_reads_R1.fastq
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対応絵文字はコードから確認して下さい（リンク）。
同じデータをfastqcでも分析。
> fastqc #GUI起動
NovaSeqのクオリティはかなり良好ですね。
ちょっとしたジョークアプリだと思いますが、真剣に導入したくなりました😬😬😬。
引用
https://github.com/lonsbio/fastqe
