phylogenetic tree viewer
2020 7/2 誤字修正 系統樹は、生物学やその他の科学分野において重要なツールであり、様々なデータタイプのコンテキスト化としても機能している。このことは、このような系統樹を作成するためのツールが頻繁に使われていることからもわかる(MEGA, (ref.2))。…
系統解析は、生物学の多くの研究分野の中心であり、通常、相同な配列の同定、それらのマルチプルアライメント、系統樹再構築、および推定されたツリーのグラフィカルな表現を伴う。 Phylogeny.frプラットフォームは、これらのタスクを自動的に実行するプログ…
系統樹の推論と解釈は、広範囲の生物学的領域（比較ゲノミクス、機能予測、メタゲノミクス、種同定、分類学、分子疫学、集団遺伝学など）を対象とする多数の研究で必要となる。Phylogeny.fr（ref.1）はもともと、次の手順に基づいてワークフローを実装するこ…
系統樹の可視化は、計算系統学（computational phylogenetics）の極めて重要な側面である。確かに、よく知られているテキスト「Inferring Phylogenies」（Felsenstein、2003）(amazon) は、このトピックに全章を割いている。従って、系統樹可視化ソフトウェ…
2019 10/30 引用追加 Multiple sequence alignment （MSA）は、biological sequencesの比較分析において重要なステップである。著者らは、MAFFT [論文より ref.1、2]を使用してウェブ上のMSAを計算するためのオンラインサービスを提供する。 MAFFTには、何千…
