2023-06-11から1日間の記事一覧
automated pipeline
2023
Preprint
COG
web tool
結果の視覚化 (visualization)
orthologue
Singularity
docker
phylogenetic tree viewer
UniProt
PFAM
KEGG pathway
ゲノムの解析と比較は、アノテーション、オルソロジー予測、系統推論などのタスクのために、さまざまなツールに依存している。しかし、ほとんどのツールは単一のタスクに特化しており、結果を統合して可視化するためにはさらなる努力が必要である。このギャ…
2023
de novo transcriptome
scRNAseq
Nature Communications
Nanopore direct RNA-seq
polish
reference free
Reference-assisted assembly
ロングリードシーケンス技術は、その登場以来大きく進歩した。そのリードの長さは転写産物全体に及ぶ可能性があり、トランスクリプトームを再構築するのに有利である。既存のロングリードトランスクリプトームアセンブリ手法は、主にリファレンスベースであ…